A kronobiológia működésmódját három szinten vizsgáljuk:
- Fizikai szinten
- Érzelmi szinten
- Szellemi szinten
A fizikai temperamentum megmutatja az idegrendszer erejét, valamint ragaszkodásunk mértékét személyekhez, tárgyakhoz, szokásokhoz. Az érzelmi temperamentum megmutatja az érzelmi tűrőképességünket. Az érzelmi szintből olvashatjuk le a saját érzelmi igényeinket, azt, hogy mennyire vagyok fontos magamnak, mennyire fontosak a hozzám közelállók. Mennyit teszek magamért és mennyit másokért. Mennyire vagyok beleérző és elfogadó mások érzelmei és dolgai iránt. A szellemi szint megmutatja az intellektuális produktivitásunkat és a két agyfélteke összehangoltságát és működésmódját. Azt, hogy hogyan van jelen életünkben az intuíció és hogyan lehetünk eredményesek az életben. Itt látjuk a gondolkodásunk működésmódját és azt, hogy hogyan dolgozunk az életünkben.
A kronobiológia szerint nincs rossz tulajdonság, csak a hozott tulajdonságokkal nem feltétlenül tanulunk meg előremutatóan, pozitív módon bánni. Amennyiben például valaki azt észleli magán, hogy időről időre vad, agresszív késztetései vannak, akkor az agresszió elfojtása és a dühkitörések miatt érzett zavar és szégyen helyett - amelyek mindegyike csak pazarolja az energiát - meg kellene tanulni elfogadni és pozitív hajtóerővé alakítani ezt a zabolázhatatlannak tűnő, vad erőt.
A kronobiológia ismerete és gyakorlati alkalmazása a párválasztás területén is jelentős. Érdemes szakember segítségével személyiségtérképet készíteni és kozmikus óráinkat összehangolni.